Nature：新冠患者转为重症的预警因子被挖掘出

COVID-19病人的展现可以从的人会收纳、轻症到需要呼吸机甚至活体细胞膜肺氧合（ECMO）维持生命的危门诊症状，这其中的关键决定性状况仍然有待验证。同时，新型冠状HIV是否在散播步骤中引发明显的基因突变，导致HIV毒力和传染性的忽略，也急需进一步数据分析。

自登革热时值之后，复旦大学附属静安区而立共卫生诊疗为中心（以下原称而立卫为中心）与裂解中医各地区重大科技基础而立共设施（苏州）（以下原称而立共设施）、苏州公共卫生数据分析中心、中医原核生物学各地区重点的实验室、瑞金医院诊疗HIV学的实验室，复旦大学苏州中医院分子可HIV的实验室、苏州交通大学中医院附属同仁医院、中科院植物生理反应生态学数据分析中心、苏州巴斯德数据分析中心和苏州营养与身体健康数据分析中心等的单位通力合作，就新型冠状HIV原核生物、分子可公共卫生特点、疟疾诊疗形态透过了深入数据分析。

5月20日，《Nature》杂志发表了这一设计团队的最新数据分析结果。仅仅只是，而立卫生为中心卢洪洲教授与而立共设施主任陈赛娟院士领衔的联合攻关设计团队，整理了而立卫为中心在2020年1月20日-2月25日期间收治的326则有症状标本，对HIV原核生物生物体、诊疗展现特点和病原体忽略等信息透过了全面深度深入数据分析。

数据分析设计团队不断改进关键技术方法，高质量顺利完成了112则有新冠HIV原核生物测序、组装和解析。他们基于HIV原核生物脱氧核糖核酸的形态树深入数据分析发掘出，新冠HIV主要有两个谱系（Clade I 和Clade II）。已确认有华中海鲜市场竞争接触史的6则有症状大多集中在其中一个小枝中（Clade I），而Clade II症状无该接触史，指引COVID-19登革热的引发并不以外华中海鲜市场竞争。

新冠HIV原核生物形态树

接着，通过对登革热暴发的不尽相同时间过渡期和不尽相同区域症状的新冠HIV基因脱氧核糖核酸（截至2020年3下半年）生物体形态的比较深入数据分析，从苏州传染病分离的HIV原核生物中识别了169个核酸忽略，其重复用到的突变与已而立布的HIV脱氧核糖核酸明确，呈现较为稳固的形态步骤，指引该HIV可能在登革热早期就已适应在人类宿主中散播。同时他们发掘出， 新冠HIV两个谱系的散播性、致病性和诊疗展现等层面无显著关联，未发掘出与COVID-19门诊症状有显著相关的HIV生物体脱氧核糖核酸。

COVID-19病人红细胞叠加

数据分析人员从诊疗和药理学数据分析发掘出，COVID-19症状红细胞明显增加，尤其是门诊症状CD4+和CD8+ T细胞呈显著透过性下降趋势，且炎性蛋白酶IL-6和IL-8明显增高。COVID-19疟疾演进严重程度的关键状况主要与症状平均年龄、基础疟疾及红细胞增加和相关的蛋白酶百慕大表征，为疟疾向门诊转变的关键预警因子。

这一数据分析结果本质甚深，对于进一步明白新型冠状HIV的分子可流行病形态、疟疾引发演进结构上，为门诊病人早期诊断和治疗，以及为药物和HIV制造提供了重要的参考依据。

此外，数据分析设计团队还向中国各地区组学信息百科全书（The National Omics Data Encyclopedia，NODE） ()、世界性SARS脱氧核糖核酸信息库(GISAID)和NCBI的的国际脱氧核糖核酸信息库（SRA）送交了112个传染病的新冠HIV原核生物高质量脱氧核糖核酸信息。同时，而立共设施也搭建了重大疟疾大信息平台新冠HIV原核生物信息交互式、开源网络深入数据分析网站（）。国内外科研机构和科学研究大多可完全共享相关数据分析信息。

原始原文：

Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020